Введение
Глава 1. Облигатные паразиты клеток
Виросфера и ее метагеном
Сложность и «темная материя»
Эгоистичная информация и смысл понятия «вирусный»
Возникновение эгоистического репликатора
Империя вирусов
Глава 2. Вирусы, гены и экосистемы
Образ жизни и жизненные циклы
Лизогения: тренировка терпения
Убить победителя
Генные брокеры
Эгоизм – движущая сила адаптивной эволюции
Фаги и микробиом
Недружественная конкуренция
Химическая война
Глава 3. Усугубление бактериальных болезней фагами
Очарование больших трудностей
Токсичные помощники
Выберите свой яд
Острова сокровищ
Индукция профага и устойчивость к антибиотикам
Глава 4. Вирусы и высшие организмы
Вирусы, клетки, организмы и популяции
«Просто вирус»
Риновирус человека
Необычное разнообразие
Гримасы патогенеза
Мутация, генетическое разнообразие и квазивиды
Глава 5. Грипп: не простуда
Мастер по смене антигенов
Вирус A гриппа человека
Эпидемия гриппа: одежда по сезону
Квазивиды, кластеры последовательностей и пристрастия кодонов
Сопоставление генетической и антигенной эволюции
Зарождение сезонных эпидемий
Пандемический грипп: голый император
Глава 6. Альтернативная жизнь вирусов
Латентное заболевание: до тех пор, пока смерть не разлучит нас
Все семейство вирусов герпеса
Глава 7. Механизмы эволюции ДНК-содержащих вирусов
Дупликация и захват гена
Эволюция поксвирусов
Фокусы поксвируса
Эволюция мелких ДНК-содержащих вирусов
Глава 8. Вироиды и мегавирусы: крайности
Вироиды: мельчайшие из мелких
Эволюционный реликт
Мегавирусы: самые крупные
Большие и очень большие
Вирофаги: блоха на блохе
Химеризм
Происхождение мегавирусов: в основе маверики
Глава 9. ВИЧ-1: самая молодая пандемия
Новая болезнь и новый вирус
Анатомия ВИЧ-1
ВИЧ в процессе сотворения
Социоэпидемиология СПИДа: рукотворная эпидемия
Эволюция в организме хозяина: очень личная гонка вооружений
Близорукая эволюция
Адаптивная эволюция: развивающиеся отношения
Обогнать Черную Королеву
Лекарство на линии фронта между вирусом и хозяином
Сопротивление бесполезно
Глава 10. Межвидовые инфекции: средства и возможности
Фотогалерея преступных вирусов
Адаптивная эволюция зооноза
Ландшафт приспособленности
Меняющийся ландшафт приспособленности
Парадокс эволюции РНК-содержащих вирусов
РНК-содержащие вирусы и молекулярные часы
Арбовирусы: трансмиссивные вирусы
Эволюционный компромисс
Ограничения со стороны хозяина
Глава 11. Грядущая пандемия гриппа: враг у ворот
Реально существующая опасность
Уровень пандемической опасности
Пандемический фенотип
Вспышка
Глава 12. Вирус Эбола
Геморрагическая лихорадка Макона
Что мы боимся говорить о лихорадке Эбола
Эволюция адаптивных изменений
Сохранение эболавирусов
Глава 13. Вирусные зоонозы и животные резервуары
Обычные подозреваемые
Происхождение филовирусов
Летучие мыши и вирусные зоонозы
Особые отношения
Толерантность и резистентность
Глава 14. Эндогенные ретровирусы: наше вирусное наследие
Ретровирусная инвазия геномов
Процесс включения эндогенных элементов
Агенты перемен
Приручение генов ЭРЭ
Эндогенные вирусные элементы
Глава 15. Вирусы как инструмент
Вирус миксомы: биологический контроль
Геномика ослабленного провируса
Ортопоксвирусы: прошлые решения и будущие проблемы
Живые ослабленные вирусы
Ослабление по плану
Лечение вирусами
Маленькие помощники врача
Онколитические вирусы
Глава 16. Заключение: человечество и вирусы
Будущее человечества и вирусы
Сотворение красоты
Благодарности